กระทรวงพาณิชย์ มีส่วนราชการ ดังต่อไปนี้
(1) สำนักงานรัฐมนตรี
(2) สำนักงานปลัดกระทรวง
(3) กรมการค้าต่างประเทศ
(4) กรมการค้าภายใน
(5) (ยกเลิก)
(6) กรมเจรจาการค้าระหว่างประเทศ
(7) กรมทรัพย์สินทางปัญญา
(8) กรมพัฒนาธุรกิจการค้า
(9) กรมส่งเสริมการค้าระหว่างประเทศ
(10) สำนักงานนโยบายและยุทธศาสตร์การค้า
[คำว่า “กรมส่งเสริมการค้าระหว่างประเทศ” ได้เปลี่ยนชื่อจากเดิมโดยผลของพระราชกฤษฎีกาเปลี่ยนชื่อกรมส่งเสริมการส่งออก เป็นกรมส่งเสริมการค้าระหว่างประเทศ พ.ศ. 2555]