อธิการบดีมีวาระการดำรงตำแหน่งคราวละสี่ปี และจะทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ แต่งตั้งใหม่อีกได้ แต่จะดำรงตำแหน่งเกินสองวาระติดต่อกันมิได้
เมื่ออธิการบดีพ้นจากตำแหน่งให้รองอธิการบดีและผู้ช่วยอธิการบดีพ้นจากตำแหน่งด้วย
นอกจากการพ้นจากตำแหน่งตามวาระ อธิการบดีพ้นจากตำแหน่งเมื่อ
(1) ตาย
(2) ลาออก
(3) ขาดคุณสมบัติหรือมีลักษณะต้องห้ามตามมาตรา 35
(4) สภามหาวิทยาลัยมีมติให้ถอดถอน
(5) ถูกจำคุกโดยคำพิพากษาถึงที่สุดให้จำคุก
(6) เป็นบุคคลล้มละลาย
(7) เป็นคนไร้ความสามารถหรือคนเสมือนไร้ความสามารถ